Grundlegend für die Medizin ist die Kenntnis vom Bau des menschlichen Körpers. In seiner Dauerausstellung gibt das Institut für Anatomie und Zellbiologie den Besucher*innen Einblick in die Geschichte der Sammlung, zeigt die Methoden zur Herstellung anatomischer Präparate und erläutert den Bau und die Funktion des menschlichen Körpers. Die Geschichte und bedeutende wissenschaftliche Traditon des Instituts spiegelt sich in seinen historischen Exponaten, zahlreichen Unikaten sowie in seltenen Wachs- und Gipsmodellen, darunter auch ein Gall'scher Schädel und die Skelette der beiden Räuber Schinderhannes und Schwarzer Jonas. Darüber hinaus sind optische Instrumente aus dem 19. Jahrhundert und alte Schriftstücke, zum Beispiel ein Präparatebuch von Jakob Henle oder ein Präparandenbuch (ab dem Jahr 1844), ausgestellt. Weiterhin werden Korrosionsmodelle, Plastinate, mazerierte Knochen, Eingusspräparate, Aufhellungspräparate nach Werner Spalteholz oder wertvolle Lehrtafeln gezeigt.